秦始皇的万余妻妾生儿子不过二十几人，女儿也是二十余人。秦二世没有后代留世。而且，秦始皇的儿女们大多和秦王朝一起走进了坟墓。秦始皇儿子有十几个，比较有名的是以下4个，其他都没有任何记载，无从考证。长子扶苏：被赵高假诏赐死……
少子胡亥：胡与赢两字通用，事实上秦二世既姓胡又姓赢。公子高：始皇帝、二世皇帝时代的公子。嬴姓赵氏。秦始皇嬴政之子。公子将闾：中国秦朝始皇帝、二世皇帝时代的公子。嬴姓赵氏。秦始皇之子。始皇帝死后、幼子胡亥即位为二世皇帝，公子将闾三兄弟拔剑自杀。
近年来，秦陵考古的新发现，为我们提供了这方面的线索。1976午10月，在秦陵东侧上焦村附近发现了一组陪葬墓群，共17座，考古工作者发掘了其中8座，8座墓中各有一棺一停;其中7座墓中各有人骨一具，五男二女。一座墓中，棺内只有一把青铜剑，未有人骨。令人不可思议的是棺中尸骨非常零乱，有的躯体与四肢相分离，有的头骨与躯干相分离，有的头骨上有箭头，这些现象表明墓主系非正常死亡。
但同时令人不可思议的是，墓中的随葬品非常丰富，计有金、银、铜、铁、陶、玉、蚌、贝、骨、漆器及丝绸残片二百余件，这种规格说明墓主人是有一定身份的。这些有一定身份而又遭到残酷杀害的墓主都葬在陵园附近，说明他们必然与陵园陪葬有关。这使人联想到被残酷杀害的秦始皇子女。
在发掘过程中，人们在墓坑里还发现了挖墓人烤火的遗迹。这说明当时天气很冷，这与胡亥诛杀诸公子的时令相吻合。因此，专家分析，这些墓葬的主人很可能是秦始皇的儿女，在发掘中还发现了两枚私印，一枚“荣禄”，出土于男性墓中;一枚印文为“阳滋”，出土于女姓墓中。如果惟断正确，则“荣禄”是秦始皇儿子的名字，“阳滋”是秦始皇女儿的名字。
随着挖掘深人，人们将取得更多的证据，到时秦始皇子女下落之谜有可能被彻底解开。扶苏和胡亥都姓嬴，扶苏胡亥都只是他们的名字，胡亥的名字应该是因为胡亥的母亲姓胡，是秦始皇后期的宠妃，由于方士所言“亡秦者，胡也”而杀死胡亥的母亲胡姬，或许是对于胡姬的怀念而将“胡”作为名字放入胡亥的名字中。
而且诸侯的儿子被称为“公子”是在春秋战国时就盛行，例如齐国国姓为姜，而齐桓公被称为公子小白，并不加姓氏在“小白”前，而且“小白”是齐桓公的字，那么照这样推测，扶苏、胡亥也可能只是他们的表字(况且也没人姓扶的吧，至少我没听说过)。
