巴西龟烂甲病一般是由于甲壳受磨损后，细菌侵入而导致甲壳溃烂。当然也有可能是因为也有可能是收到机械性损伤，如野外捕捉时或运输途中受到硬物碰伤，或者从高处跌落导致甲壳受损。在发现巴西龟烂甲之后，家长应该及时处理并且进行诊断治疗。
治疗巴西龟的烂甲病，可以先用酒精棉把针和指甲钳消毒干净；在用指甲钳小心将病灶处的外壳剪一小口；然后用针小心将白色腐烂的甲一点一点挑除，贴近生肉的地方要先用针轻轻试探一下。需要注意的是，如果发现巴西龟挣扎得很厉害，那么就表示那块挑拨的肉是健康的，此时家长就应该停止动作了。
接下来应该用酒精棉轻轻擦拭伤口处，让酒精棉的酒精能渗透进去，然后稍待伤口处的酒精风干；再将金霉素药膏填满伤口凹处。因为金霉素药有一定的防水性，在给巴西龟填好药膏后，等上10分钟就可以将巴西龟再次放入水中了。当然，此时的水应该是更换过的更干净的水。
在治疗期间，家长应该多给巴西龟准备一些小鱼或者骨头类的食物，因为这些食物营养丰富，可以促进新甲的健康生长。同时，每次换水的时候，都不能直接使用自来水。所选择的自来水一定要先经过太阳暴晒，然后才能饲养巴西龟。
一般来说，在饲养者精心的养护、管理之下，巴西龟的烂甲病在1周左右就会有明显的治愈效果。在此期间，家长还应该定期用酒精棉消毒伤口后再填药膏，直到巴西龟的烂甲病痊愈为止。此外，当巴西龟的伤口处长出新的甲片，就表示巴西龟的伤口处于恢复，相信很快巴西龟就可以痊愈了。
